Для проекта с использованием Qt - qmake.
без Qt - cmake

Поскольку это Qt-форум, проголосовал за qmake

А как нынче с поддержкой qbs в креаторе?
Раньше добавить/удалить/переименовать файл без правки файла проекта было невозможно (

Кстати, с последним обновлением в qtcreator улучшена поддержка cmake. Теперь имеются профили сборки с задаваемыми переменными.

а что нет в qmake, что есть в qbs или cmake?
qbs не знаю, cmake не знаю - мне хватает qmake )
каких удобств я лишаюсь используя qmake ?

>>каких удобств я лишаюсь используя qmake ?
Если у тебя в исходниках есть одноимённые файлы, например:
diagram/utils.{cpp|h}
metrology/utils.{cpp|h}

То ты лишаешься возможности собрать проект. Т.к. qmake все объектники валит в один каталог, т.е. получится так:
сначала скомпилится diagram/utils.{cpp|h} и получится utils.o
затем скомпилится metrology/utils.{cpp|h} и получится utils.o, который перезапишет предыдущий.

в остальном мне больше нравится qmake, по сравнению с cmake и qbs

Визардами не пользуюсь, мне от них никакого толка нет, они не знают структуру файлов моих проектов. Создаю файлы ручками, напряжным это не считаю. Файл проекта при этом не меняется. Остаётся только в креаторе один пункт меню ткнуть.


Я CMake тоже не знаю, так что за него не скажу. В Qbs намного проще описывать сложные проекты, состоящие из множества модулей (библиотек, приложений). Зависимости одних модулей от других разруливаются намного лучше, и не зависят от расположения модуля в файловой системе, на чём спотыкается qmake. Удобнее описывать структуру проекта, можно написать "модуль" который потом применяется как шаблон для продукта. Можно заводить переменные в файлах проекта, и в дочерних проектах доступны переменные супер-проекта, в qmake с этим тоже затык. Скорость сборки больших проектов выше. Репарсинг проектных файлов больших проектов намного выше. Это навскидку. А так в Qbs намного больше полезных плюшек, чем в qmake .