Спасибо за ответы, повожусь с настройками еще.
А что есть синерама?
Xinerama is an extension to the X Window System which enables multi-headed X: applications and window managers which use two (or more) physical displays as one large virtual display.
Вас в google и wikipedia (
http://en.wikipedia.org/wiki/Xinerama) забанили

Для вашего случая Qt должен быть собран с поддержкой Xinerama. Хотя вот вопрос, если вы уже работаете в
мультмониторном режиме, у вас в качестве десктопа что стоит, не KDE

Вроде все известные мне дистрибутивы собирают пакет Qt с поддержкой Xinerama. Так что все это странно. Или у вас Qt самосборная

И еще вопрос, какая у вас видеокарта и соответственно драйвера к ней?