Народ никто не сталкивался с проблемой.
Иногда всё-таки нужно использовать знаки препинания. Я практически не понял вопроса. Кажется автор утверждает, что в папку с его Qt приложением начинают сохранять временные файлы другие левые приложения?
Тогда надо уточнить, эти левые приложения ты запускаешь из своего приложения? Если это так, то текущую папку может сбить диалог открытия файла, например. И соответственно, вновь порожденные дочерние процессы могут гадить уже туда, так как они наследуют текущую папку у родительского процесса.